onsdag 26 september 2018

DNA KAN INTE LJUGA - del 2)



Det finns uppfödare som ständigt upprepar, att man inte bara kan avla på  siffror, som om  någon har gjort det, eller förespråkar att det skulle göras. Siffror representerar en verklighet. Ofta en verklighet, som ingen av oss kan se med blotta ögat eller har framför egen näsa. Det kanske är svårsmält, men så är det. Det är det man har statistik till.

Följ diagrammet i tabellen från vänster till höger för varje ras! Första siffran är den effektiva populationen - hoppa tills vidare över den, för det räcker att bli uppskrämd över en sak i taget, även om den siffran och de andra hänger ihop. Titta  på hur siffrorna sjunker från helstamtavleanalys över tiogenerationsanalys ner till femgenerationsanalys. En genomsnittlig inavelsgrad för basenji på bara 5,9% på fem generationer - det låter väl inte så farligt? 
På tio generationer är den dubbelt så stor: 11,8%.  Räknat över alla generationer dubbelt så stor igen: 22,1%. Det är ändå mellanmjölkssiffror siffror jämfört med SNP på 53,6% homozygoti från 10 hundar och helgenomsekvensen på 57,1% homozygoti hos en hund.

Table 2.

Average inbreeding, F, calculated from pedigree data for the entire breed pedigree, ten generations or five generations, and from SNP chip and whole genome sequence (WGS) heterozygosity
An external file that holds a picture, illustration, etc.Object name is dmm-9-027037-i2.jpg



F-value calculations from both SNP genotypes and WGS data are higher than the pedigree analysis across all but the youngest breed (Nova Scotia Duck Tolling Retriever), with the SNP analysis showing a range of 0.179 (Papillon) to 0.536 (Basenji), and WGS F-values ranging from 0.118 (Portuguese Water Dog) to 0.571 (Basenji) (Table 2). Comparing F-values from subsets of the pedigrees, we observed the largest inbreeding coefficients when using the entire reference pedigree and the smallest inbreeding coefficients when examining only the most recent five generations in all breeds.

(Från studien av Dreger et al, se föregående inlägg)

Pekar allametoderna åt samma håll? Ja, men DNA-metoderna pekar med hela handen.  När alla tre metoderna visar på samma sak, ger de tillsammans en högre grad av tillförlitlighet än varje metod för sig. Genomgående ligger SNP-beräkningarna av inavelsgrad högre än stamtavleberäkningarna, medan helgenomavläsningen jämförd med SNP ligger på någorlunda samma nivå . Slutsatsen blir än en gång att stamtavlor över ett fåtal generationer ger falskt låga resultat. Den insikt de ger räcker inte, tvärtom – de ger den seriösa uppfödaren en  känsla av obefogad trygghet. 
Ju fler generationer den stamtavlebaserade inavelsgraden baseras på, ju högre inavelsgrad får man; men även om man räknar på alla generationer ger enbart stamtavlor en klart lägre inavelsgrad än de två DNA-baserade metoderna. DNA ljuger inte. Renrasaveln har producerat skrämmande höga inavelsnivåer och de som ägnar sig åt den vet inte om det.



Det här blev en lång förklaring. Orsaken är att Carol Beuchats grafiska sammanställning av resultaten gjorde mig chockad. Någonstans hoppas jag fortfarande, att det inte stämmer. För så här ser hennes staplar över inavelsgraden hos våra hundar ut.
Det gröna strecket är inavelsgrad på 6,25, motsvarande en kusinparning. Det gula är 12,5%,  motsvarande en halvsyskonparning. Och det röda är 25%, motsvarande en far/dotterparning eller en helsyskonparning. De allra flesta  raserna ligger högre än så.
Ni ser själva nivåerna.

Stapeldiagrammet från Carol Beuchats Inbreeding in pedigree dogs determined from DNA

Man kan givetvis invända, att det är ett litet antal hundar för varje ras, men då får försöka hitta en förklaring till att över 800 hundar på 80 raser ser resultaten likartade ut. Man kan också  invända, att det enbart är amerikanska hundar som ingår. Särskilt kan detta vara värt att komma ihåg, när det gäller lundehundens överlägsna topplacering: om man importerar ett litet antal hundar från en ras med redan extremt hög inavelsgrad och sedan i det nya landet avlar på det lilla man har, kommer inavelsgraden självklart att stiga ännu mera. Därmed  kan det finnas skäl att tro, att den nu är högre i USA än i hemlandet. Men även bortsett från lundehunden finns resultat från andra forskare som tittat på andra raser och som presenterar liknande inavelsnivåer inom renrasaveln. Så då får man försöka hitta något bra skäl till att avelstraditionen i USA skulle vara radikalt annorlunda än den europeiska.

Man kan också titta på resultaten från andra hållet och göra en rimlighetsbedömning. Då frågar man sig: utfrån det vi vet om lundehundens rashistorik och sjukdomsfrekvens, är det vettigt att tänka sig att verklig COI ligger högst av de granskade raserna? Från det vi vet om bullterrierns korta förväntade livslängd, är det rimligt att anta att förklaringen ligger gömd någonstans i den skyhöga inavelsnivån? Från det vi vet om krigens brutala flaskhalseffekter för doberman och den internationella utbredningen av anlaget för en dödlig hjärtsjukdom, är det troligt att verklig inavelsgrad ligger över 40%? Från det vi vet om colliens långa tid med sluten stambok och den intensiva inavel som har bedrivits, är det rimligt att tänka sig att en genomsnittlig inavelsgrad på cirka 50% faktiskt  finns och förklarar varför vi inte kan avla oss bort från CEA och colobom?
Tyvärr tror jag, att det kan vara så. Inte minst för att ännu en genetiker, Dr. Niels Pedersen vid UC DAVIS Veterinary Genetics Laboratory – han som skrev den utmärkta rashistoriken över doberman på labbets hemsida – på direkt fråga säger i ett mail, att han har hittat flera raser med en genomsnittlig DNA-mätt COI på ungefär 60%. ”DNA doesn´t lie” - det är hans kommentar till skillnaden mellan stamtavleberäkningar och direkta DNA-baserade mått.
Om detta stämmer, om de här siffrorna och staplarna stämmer, är det hög tid för oss att tänka till, för i de här diagrammen siktar man ingen långsiktig överlevnad. Lundehundsfolket har tagit det oundvikliga steget för att säkra rasens fortsättning. Collie har haft turen att klara sig ifrån de uppenbara genetiska haverier som drabbat andra raser högt upp på listan.
Men tur brukar inte hålla i sig och det finns andra haverier än de som skriker högt.


Bodil Carlsson


tisdag 25 september 2018

DNA KAN INTE LJUGA

Den här artikelserien, som började vid midsommar och slutar nu, har tittat in på flera raser och deras olika genetiska problem. Lundehund. Doberman. Boxer. Bullterrier. Collie.
Här möter ni flera av dem igen - plus ett antal andra - i ett blogginlägg, som liknar en svensk deckare. Man trampar sig mödosamt fram genom alla beskrivningarna i inledningen, men de gastkramande grejorna kommer på slutet.  Det  handlar om verkliga inavelsgrader. De är inte vad vi tror att de är.


Förr fanns ett enda sätt att beräkna inavelsgrad eller COI, coefficient of inbreeding, som är den andel av ett djurs gener som i genomsnitt är identiska med generna hos andra djur av samma ras med sluten stambok, alltså mera eller mindre släkt. Man fick använda stamtavlan. Så görs det fortfarande i angivandet av COI – standard är COI beräknad på tre, eller fem, eller sex, generationers stamtavla; någon enstaka gång på tio. Att gå längre bak än så kräver mycket tid och/eller datorkapacitet. Samvetsgranna uppfödare har legat på mage på golvet med enorma pappersark och många kvällars jobb framför sig och ändå inte haft en rimlig chans att få till det över mera än några generationer. För även om man har tiden och tålamodet, blir namnen och generationerna och släktskapsbanden mellan dem för många. Och framförallt bygger metoden på att namnen på papperet finns där, att förfäderna går att hitta, hela vägen bakåt till rasens första grundare, och att det är rätt namn - och det finns ingen garanti för någondera. Om det finns en tom plats i förfädersleden elva generationer längre bak på ena sidan och på andra sidan fjorton generationer längre bak, vad skall den stackars uppfödaren göra åt saken? Och vad händer om den där rätt så obesläktade hanen från en annan kennel fem led bakåt i stamtavlan i själva verket var tikens bror eller far? Oavsett om det berodde på en uppfödare, som ville ”prägla” avkomman lite extra (vilket förmodligen har hänt ) eller om det berodde på hundars utmärkta förmåga att fixa sina parningar på egen hand (vilket alldeles säkert har inträffat), så blir inavelsberäkningen fel.
Det är säkrare att mäta direkt från verkligheten och titta på de hundar som lever idag. Man tittar på DNA. DNA kan inte ljuga, som en genetiker sa.

Sedan några år tillbaka kan man använda två metoder till förutom stamtavlan. Båda är baserade på DNA och har en sak gemensam: de ger alltid högre värden för släktskap än vad stamtavleberäkningarna gör.
Den ena metoden använder sig av något som kallas SNP, single nucleotide pairs, och jämför vissa enskilda baspar i ett antal gener hos flera hundar av samma ras. Är de ofta olika? Skiljer de sig lite ibland? Är de ofta identiska? Man försöker undvika gener i områden, som man redan vet är likadana hos alla hundar av rasen – om man till exempel skulle få för sig att titta på SNP i området för genen för svart pälsfärg i en ras där varenda hund är svart, skulle man få ett orättvist högt värde för likadana SNP och tro, att hundarnas genetiska likformighet var större än den är. De tidiga beräkningarna av SNP använde jämförelsevis få baspar och anses idag ge för grova mått: man fångar inte så mycket fisk med nät, som har väldigt stora maskor. De senaste använder fler baspar och ses som  mera träffsäkra. Tabellen visar exempel på skillnader i inavelsgrad för några olika raser beroende på om man beräknar utifrån stamtavlan i alla generationer eller mäter direkt från DNA med SNP-metoden över 173 600 olika baspar.


  
Tabellen är hämtad från Carol Beuchats inlägg Inbreeding of purebred dogs determined from DNA och publiceras med hennes tillåtelse. Ped-full = stamtavleCOI beräknad på alla generationer från rasens början

Ni ser själva, att skillnaderna är stora mellan stamtavleanalysen och de faktiska hundarnas DNA. Enda rasen som har högre inavelskoefficient på papperet än i DNA-mätningarna är den allra yngsta rasen, den mest kortast sluten stambokstid och lägst antal generationer. ACD har i helstamtavleanalysen en inavelskoefficient på 6,4%, men DNA mätt via SNP visar på 18,5%.  Golden, i USA precis som här en av de mest populära raserna, har hos de genomgångna hundarna en stamtavlebaserad inavelsgrad på 16%. Det kan man tycka är illa nog, eftersom det ligger över halvsyskonparning i släktskap; men SNP-analysen hittar genetisk samstämmighet i drygt 28%. Basenji ser ut att ha en inavelsgrad på drygt 22% räknat på hela stamtavlan tillbaka till ett fåtal importerade afrikanska ursprungshundar, men 53% beräknat från SNP! Det finns som sagt inga ord i vårt språk för en sådan grad av släktskap. Men någonstans läser jag, att en COI på 50% motsvarar tre generationers helsyskonparningar.

                                                       * * *


 Beuchats tabell ovan baseras på en en vetenskaplig rapport publicerad i tidskriften Company of Biologists i slutet av 2016:

RESEARCH ARTICLE
Whole genome sequence, SNP chips and pedigree structure: building demographic profiles in domestic dog breeds to optimize genetic trait mapping
Dayna L. Dreger, Maud Rimbault, Brian W. Davis, Adrienne Bhatnagar, Heidi G. Parker, Elaine A. Ostrander
Disease Models & Mechanisms 2016 : dmm.027037 doi: 10.1242/dmm.027037 Published 17 November 2016





Assessment of inbreeding coefficients by data type
The breed average inbreeding coefficient (F) was calculated three ways: (1) pedigree analysis from five generations, ten generations or the entire breed reference pedigree; (2) from SNP genotype homozygosity analysis averaged over multiple dogs per breed; and (3) from WGS homozygosity analysis of one dog per breed.


Inavelsgraden för 80 renraser bedömdes alltså på tre sätt. Först gjordes en stamtavleanalys på fem generationer, tio generationer och slutligen hela stamtavlan av tio hundar i varje ras. Sedan gjorde man en uppskattning av genetisk likformighet, homozygoti, med SNP-metoden på samma hundar i varje ras. Slutligen gjorde man en hel genomanalys, en WGS (whole genome sequencing)  av en hund från varje ras– sammanlagt 800 hundar från 80 AKC-raser.
Och så jämförde man resultaten med varandra. Det är poängen med den här studien: man samkör tre olika metoder. En metod som man vet har lägre säkerhet, stamtavlan; en metod med högre men fortfarande otillräcklig säkerhet, SNP-analysen; och en metod som inte kan visa fel, men som man (av kostnadsskäl) bara gör på en hund, alltså avläsning av hela den genetiska koden med kontroll av hur långa sträckor av homozygota (dubblerade) gener som finns där. Långa sträckor av homozygoti (förkortat RoH, runs of homozygosity) skapas genom inavel. Ju intensivare och ju längre man har inavlat, desto längre blir de likformiga genavsnitten.
När man ställer upp de tre metoderna intill varandra, vad blir det då för resultat? Rafflande.

Bodil Carlsson 

måndag 24 september 2018

HUNDARNA PÅ ISLE ROYAL: om rasers nytta av kennelklubbar

Alla  kanske inte känner till vargarna på Isle Royal, men alla har väl hört om  lundehunden? En liten norsk spetsvariant med sex tår. Lundehunden undergår en genetisk rekonstruktion, det är det nya med den, men dess historia är klassisk. Den går några hundra år tillbaka – inte som ras, men som hundtyp – som arbetsredskap och hjälpreda åt fattigt folk, som behövde kunna jaga lunnefågel för att få tag på mat och dun. Lunnefåglar har en jobbig vana att grotta in sig i sina nästen i branta klippväggar för att få skydd. Lunnehunden var följaktligen liten, men envis. Den hade en överrörlighet i nacken och axellederna som gjorde den smidig och vig – säkert en fördel om man skall borra sig in i håligheter i bergför  att sedan backa ut med fågeln – och alltså sex tår på varje fot. Lundehundsfolket trodde att de extra tårna gjorde att hunden fick bättre fäste i klippväggen och möjligen ligger det något i det, även om hundfolk i alla tider har varit suveräna på att hitta anledningar till att en genetisk tillfällighet passar väldigt bra på just deras hund. ( Det finns människor med sex fingrar, men vi brukar inte påstå att de är bättre pianister.) Det skulle mycket väl kunna vara så, att de sex tårna på varje fot markerar en tidig genetisk isolering – någon gång kom de där hundarna till, gissningsvis som blandat gods från andra småvuxna nordiska spetsvarianter, och sedan hölls de på sin ö utanför norska kusten och en mutation slog igenom, som kanske gjorde hunden till en bättre klättrare, men i vilket fall inte gjorde den sämre. Alltså fick den extra tån vara kvar och kom att ses som ett uppskattat kännetecken för just de hundarna.
Det som sedan hände är också klassiskt. Folk skaffade nät. Lunnefåglarna fångades lika bra med nät som med hund, nät behöver inte utfodras och alltså minskade hundarna i antal. Det gjorde med tiden lunnefåglarna också – så till den grad att fåglarna som hade jagats ett tag var lika utrotningshotade som hundarna, som hade jagat dem. Då blev det ännu färre hundar. Det lär ha funnits fem lundehundar kvar runt 1945 efter en valpsjukeepidemi. Stammen växte igen från den basen men då kom nästa omgång valpsjuka. Vad fanns kvar? Fem närbesläktade hundar, en mindre närbesläktad och så en liten grupp människor, som älskade sin ras. Där börjar nästa kapitel.

Det finns mellan 1 500 och 2 000 lundehundar i världen idag. De flesta i Norge, men nästan hälften i andra länder: Sverige, Finland, Danmark, USA, med enstaka spridda till andra länder. På sjuttiotalet exporterades ett litet antal hundar från Norge, på 80-talet kom det till utländska uppfödare och alla delar samma arv från (i bästa fall) sex hundar.
Vad hände med arvet? Det är också klassiskt. Fruktsamheten är låg och valpkullarna riktigt små, som i alla djurstammar med hög inavelsgrad; men den speciella sjukdom som hände lundehunden var intestinal lymfangiektasi. Namnet är så krångligt att det förkortas IL, men betydelsen av orden är att lymfkärlen runt tarmen inte ligger som de borde och inte fungerar som de ska. Livsviktiga ämnen läcker från dem ut i tarmen, medan kroppsvätska inte kan transporteras bort. Följden är en kombination av diarréer, proteinbrist och ödem, som ofta är dödlig. 30% av lundehundarna sägs dö i detta. ( Nej, det hindrar inte olika rasklubbar i länderna från att annonsera lundehunden som en ”frisk ras”. ) Lämnad åt sitt öde skulle lundehunden ha gått samma väg som de berömda vargarna på Isle Royal, som dog i sjukdomar och ömklighet efter många år av inavel på sin ö på gränsen mellan USA och Canada*.
Nu blev det inte så. Lundehunden är sedan 2013 föremål för organiserad utkorsningsavel. Inte en utan tre andra närbesläktade raser (norsk buhund, isländsk fårhund och norrbottenspets) används – likartade hundtyper med troligt delvis gemensamt ursprung. Norska kennelklubben ansvarar för projektet och norska universitet deltar med genetiska och tekniska kunskaper, liksom NordGen, som bevarar gamla tiders växtfröer och härdiga hönsstammar för framtiden. Det engelska uttrycket för detta är preservation breeding: bevarandeavel.
Knepet med det här projektet är, som ni ser, att blanda rätt. Ni bygger på de gener, som är gemensamma för lundehunden och de tre andra likartade raserna - misslyckas man med det, så förlorar ju lundehunden sin sin karaktär av liten spets. Nu är ju alla fyra omisskännliga spetstyper, så den risken är kanske obefintlig. Ni vill samtidigt inte tillföra för mycket av de gener, som gör islänningen till islänning, ger norrbottenspetsen dess norrbottnighet och buhunden dess buhundighet: ni vill ha lundehundens fenotyp kvar, både i utseende och beteende. Ni vill absolut inte att de sex uppskattade tårna förloras i blandningen... samtidigt som ni vill bli av med rätt många av de gener, som lundehunden har gemensamt bara med sig själv, inklusive de ännu okända gener som ger IL.
Och så vill ni förstås få uppfödarna med er på tåget. Både de inhemska och de utländska, stolta över sin urgamla, urnordiska, sällsynta, unika ras, som måste fortsätta finnas.

Jag vet ingenting om de diskussioner som föregick utkorsningsprojektet. Men på den norska rasklubbens hemsida finns ett milt tragikomiskt inlägg på engelska. Det tar upp frågor, som kommit från något annat land. Var det kanske så, att norska lundehundsklubben tvingades starta sitt utkorsningsprojekt efter påtryckningar från norska kennelklubben?
O nej! Inte alls! Rasklubben kom själv fram till sitt beslut under arbetet med RAS. Problemet med IL och de små valpkullarna avgjorde saken. Men, fortsätter svaret, det gjordes klart  från NKK att om vi i rasklubben inte gjorde något, så skulle det bli gjort utan oss.

Det finns många bra saker som hundar kan ha en kennelklubb till. 

Bodil Carlsson 





*Parvovirus, inte valpsjuka, slog ut dem och de få som överlevde var nära släkt. De två sista levande iakttagna vargarna på Isle Royal rapporterades vara halvsyskon och far och dotter samtidigt. Men deras inavelsgrad var ändå inte högre än lundehundarnas.



lördag 22 september 2018

BÖRJAN TILL SLUTET

Vi närmar oss slutet på den här långa serien inlägg om inavelstraditionen inom hundaveln och dess följder. Den har inte alltid varit lätt att skiva och inte alltid varit rolig. Startpunkten var min egen förvåning över påståenden som kastades fram på den svenska collieklubbens årsmöte i mars. Där hävdades med eftertryck och allvar, att eftersom rasen collie har en enda immunförsvarsgen där det borde finnas flera, och eftersom någon upplevt få och små valpar, så är det ogörligt farligt att genomföra ett förslag som skulle leda till en stegvis minskning av ett väldokumenterat  problem med påvisbar arvbarhet och som bieffekt bredda den verkliga avelsbasen.
Om ni tror att ni nyss läste väldigt fel, så har jag full förståelse.


Hur är det möjligt att renrasaveln agerar på en sådan kunskapsnivå? Det korta svaret är enkelt. Hundra år av ständigt stigande efterfrågan har vant den vid framgång. Renrasavelns företrädare har fram tills nu inte haft många anledningar att reflektera över sina kunskaper; de har sålt bra ändå. Valpar, stamtavlor och image har haft god åtgång, liksom som sagorna om det uråldriga förflutna för djurstammar med knappt hundra år på nacken.
1920 fanns det runt 270 000 hundar i Sverige. En tiondel var renrasiga. Idag finns det ungefär 800 000 hundar i samma lilla land. Minst 70% är renrasiga. Vem har haft ett bra marknadsläge? 

 
Titta på det här fotografiet av hundar från nittonhundratalets början. Uppskattade nog att tas med till fotografen poserar de med sina ägare, som uppenbart tycker om dem. Det finns en slående sak till i porträtten av människor och hundar: bortsett från den omisskännliga mopsen  hade vi behövt känna  människorna för att kunna säga något om vilken bakgrund deras hundar hade. Vi hade inte kunnat säga något om vilken ras de var, för de var ingen ras alls. De var hundtyper.



1898 års hundar. Foto Signe Lidwall, eller närstående. Ingår i utställningen Hundar för hundra år sedan på Tidaholms stadsmuseum. Titta in, om ni har vägarna förbi!

Tänk er nu motsvarande foton från idag: folk i hemmiljöer eller utomhus. Vi hade kunnat rabbla rasnamn efter rasnamn utan att veta det minsta om människorna. Vi hade faktiskt kunnat radda upp fler rasnamn än för bara trettio år sedan. Hur känner vi igen våra grannar? Jo, det är ju hon med flatten. Nej, han med frallan! Menar du killen med den portugisiska vattenhunden eller han med nakenhunden? Därborta bor det några med pitbull, men där på hörnet bor chivavvorna och där borta en dansksvensk gårdshund.
Personerna på fotografiet från 1898  hade stått som frågetecken inför alla dessa namn. Att skapa och sälja  nya hundraser måste vara en av nittonhundratalets största marknadsframgångar. Den har medfört god självkänsla hos vinnarna i branschen, men  inte lika god förståelse för genetik, eller anatomi, eller mentalitet. Det har liksom inte hört till.

Det som händer nu är två saker samtidigt och de faller in över renrasaveln från var sitt håll. Genetiken går igenom en enorm kunskapsökning, som i mer eller mindre rätt uppfattad version börjar nå ut till många. Nittonhundratalets efterfrågeexplosion avtar – antalet hundar ökar inte längre och om marknaden (som det heter i affärsvärldens språk) börjar bli mättad, så betyder det rimligen att nischen i form av antal köpare för varje ras blir mindre.
Exempel: ni vill ha en  brukshund med rötter i kontinentala europeiska vallare? För fyrtio år sedan kunde ni välja mellan schäfer och schäfer. Idag finns schäfer, malle, terv, lakenois, holländsk herdehund i olika hårlag och ännu en nykomling, chodsky pes; den senaste, men kanske inte den sista, fräscha versionen av samma sorts hund.
Bara om efterfrågan generellt fortsätter att öka kan alla dessa varianter av den gamla europeiska vallhunden fortsätta öka i antal samtidigt.
Collie var den första och troligen den ojämförligt största framgångssagan i den moderna, kommersiella hundaveln – så stor, att minnet verkar leva kvar i form av bestående bestörtning över att inte lika många väljer rasen nu som då. Lassie kom hem! var bara den senaste versionen av ett antal böcker och filmer, som både levde på berättelsen om den romantiserade hunden och fortsatte förstärka den under de femtio första åren av nittonhundratalet. Författaren Albert Terhune,  född 1872, var själv uppfödare och skrev böcker med stor genomslagskraft om den ras han sålde. Han skrev om hunduppfödning u ett annat perspektiv också. Tidskriftsartiklarna ”The Dog is a Business Now” och ”The Collie: There is Money in Him”, skrivna runt 1911, framhåller bland annat att hunduppfödning är ett affärsområde där även kvinnor slår sig fram med framgång och god förtjänst. De gamla gossarna drog sig iallafall inte för att tala klarspråk, det erkännandet måste man ge dem. Man önskar emellanåt mera av samma sorts rättframhet idag.
Efter colliens dundersuccé kom sheltien, aussien, border collien, kelpien. Ni vill ha en  hund med rötter i de gamla brittiska vallhundarna? Varsågoda, för ni har ni inte längre bara en tilltalande ras att välja på utan flera. Men bara om efterfrågan generellt fortsätter att stiga, kan alla dessa raser fortsätta att öka i antal samtidigt.

Vad tror ni händer, när efterfrågan på renrasiga hundar inte längre fortsätter att öka och öka?
Det lämnar renrasaveln med ett oförutsett dilemma. Fler raser med färre individer och sinsemellan slutna stamböcker. Låter det som ett recept för framgång?
Det låter som ett recept för ökande gräl inom rasklubbar med beskyllningar om dålig reklam för rasen och rop om att slippa en massa krav som sätter käppar i hjulet för uppfödarna: blir man bara av med insyn och avelsreglering, så blir nog allt som förr igen. 
Om det känns bekant, så är det ändå det mindre bekymret. Fler raser med färre individer och slutna stamböcker betyder stigande inavelsgrader om aveln fortsätter som den har gjort. Hundarna från för hundra år sedan hade många saker att sörja över jämfört med hundarna från idag. Men det fanns helt klart en svart sida av livet, som de inte drogs med. De hade inte så höga frekvenser av inavelsrelaterade genetiska sjukdomar att de kunde ersätta laboratoriemöss som studieobjekt.


Bodil Carlsson


måndag 17 september 2018

THE STANDARD PROCEDURE: slutkläm



Cattanach och hans medarbetare skrev sin artikel, därför att de var fundersamma över genen STRN, den som man kunde testa för. Testet för mutationen i STRN kom alltså 2010. Tyvärr har det sedan visat sig, att boxer med ARVC visserligen ofta har den muterade varianten av STRN – men faktiskt inte alltid. De kan ha den normala varianten och ändå ha ARVC. Motsatsen hittades också: hundar med STRN-mutationen som inte visar tecken på ARVC. Sådana hundar har hittats i ett antal fall i England utanför de importerade amerikanska linjerna, medan ARVC har bara hittats inom de amerikanska linjerna.
Den enda logiska förklaring för Cattanach och hans team är att på samma kromosom som STRN och som mycket nära granne ligger den fortfarande okända gen, som verkligen ger ARVC. Den genen ger inte utslag i testet.

Det kan vara så, att den muterade STRN-genen påverkar sjukdomens svårighetsgrad hos en hund som har anlaget för ARVC, t ex att STRN-mutationen i homozygot version (samma variant från båda föräldrarna) ger svårare sjukdom, och man kan spekulera i om det är så att den i homozygot normalversion håller emot, så att sjukdomen visar sig senare eller i lindrigare form. Kanske är det där den ”ofullständiga penetransen” ligger? Det kan rentav vara så, att STRN- genen påverkar allvarsgraden av vilken hjärtsjukdom som helst. Ni kommer ihåg tryckknappen? Vilket problem ett hjärta än har, ARVC eller en trång klaff eller något annat, blir det förstås värre med sladdriga tryckknappar. Kämpande hjärtmuskelceller behöver hålla ihop. STRN-genen kan alltså tänkas påverka utfallet av den eller de gener, som ger ARVC. Men det är inte STRN, som orsakar ARVC.
Då blir det besvärligt. Om STRN-mutationen nu inte är den mutation som faktiskt orsakar ARVC och om uppfödarna testar för att de tror att STRN = ARVC... Då betyder det ju, att hundar som är fria från STRN-mutationen MEN har ARVC inte identifieras. Och att hundar MED mutationen men utan ARVC felaktigt blir utpekade som anlagsbärare.

Då blir effekten av gentestet att man släpper igenom anlagsbärarna och därmed riskerar att sprida den sjukdom man tror att man hejdar – samtidigt som man slår ut icke anlagsbärande hundar från avel och därmed minskar sin avelsbas.




The finding that the STRN mutation is not responsible for ARVC means that ARVC-affected dogs without the mutation are not being recognised as having the inherited ARVC, and many normal dogs with the mutation are erroneously being defined as carrying the disease. A further outcome from the conclusions is that homozygosity for the STRN mutation no longer indicates homozygosity for the actual ARVC mutation. The fate of these ARVC homozygotes is now unclear. However, STRN remains a loose marker for the ARVC gene and still identifies the gross region. It should therefore be possible to find DNA markers that are closer to the ARVC gene and that could therefore serve better for identifying dogs that carry it. Such an exercise might also help the detection of the gene itself, in humans as well as Boxers.



Kan man lära sig något av detta, oavsett vilken ras man har?
Mina högst personliga slutsatser efter att ha läst artikeln och diskuterat med Bruce Cattanach via mail:

    1) Att tester finns och kostar pengar är ingen garanti för att de visar vad de säger att de visar. Låt tiden och fristående genetiker testa testen! Test kan vara till stor hjälp. De kan vara till ingen nytta alls. Eller i värsta fall rentav blanda bort korten för uppfödarna. Den engelska rasklubbens insatser mot ARVC hade effekt alldeles utan gentest. Hade boxeruppfödarna i stället satsat på striatintestet, hade de nu troligen haft mera, inte mindre, hjärtsjukdom hos sina hundar. *
    2)En rasklubb som inser ett problem kan göra något åt det. Alla kommer inte att vilja vara med på tåget och det kommer att bli bråk, men det är den vägen man måste gå för att hejda något som man inte vill ha spritt i sin ras.

    3)En enorm fördel i Sverige jämfört med andra länder är att i stort sett alla rasrena hundar är reggade. Det är svårt att sälja oreggade renrasiga hundar till fullpris här. I det läget kan den nationella kennelklubben sätta ner foten för att stoppa spridningen av ett ovälkommet anlag som dyker upp. ”Vill ni registrera valpar hos oss? OK, det här är vad som gäller.”

    4)”Inbreeding is standard procedure in show dog breeding.” Ändra på det! Springer man i ett tidigt skede benen av sig efter populära hanar, hjälper det inte ett skvatt om man i nästa skede springer benen av sig efter gentester. Man kommer ändå inte ur fläcken. Nästa mutation sticker fram trynet och nästa larm går.
    Inavelstraditionen skapar inga mutationer. Men den förtätar de mutationer som finns i alla individer till rasbundna sjukdomar och skapar en lönsam marknad för test vars relevans är svåra för de allra flesta av oss att bedöma. Vi kommer ingenvart med genetiska sjukdomar så länge uppfödare inte förstår vilket arv traditionen att inavla har lämnat åt oss. Öppen redovisning kan förändra situationen. Ökad kunskap kan det. Organiserade insatser kan det!
    Uppfödare kommer och går, men kunskap förvarad i offentligt redovisade resultat och i regler för aveln består. Traditionell avel skapade problemen. Den nationella kennelklubbens överordnade uppgift måste vara att förändra den. Som på rasklubbsnivå kommer det inte att kunna genomföras utan bråk. Men det är nog smällar man får ta, om man vill ha en framtid för renrasiga hundar.


    Bodil Carlsson



* Se Pekka Olsons ledare i Hundsport 5/2018. Det finns alltså numera ett hav av gentester, som rimligen är svåröverblickbart för såväl uppfödare som hundägare och veterinärer. International Partnership for Dogs, IPFD, erbjuder på sidan Dogwellnet.com en översikt över kommersiella gentester. På den sidan hittar ni under Boxer testet för striatingenen under rubriken ARVC med fyra vetenskapliga studier uppradade. Det står helt kort att ”Expert advice for breeding decisions recommended. Tests not considered diagnostic at this time.” och det kan man ju hålla med om. Förmodligen väntar sig inte IPFD att uppfödare från olika språkområden på egen hand skall gå igenom och utvärdera fyra studier skrivna på engelska. Så varför inte helt enkelt sätta upp en röd stoppljussymbol för det här testet? Har Cattanach rätt – vilket jag tror – så är detta test inte bara irrelevant utan vilseledande.

söndag 16 september 2018

THE STANDARD PROCEDURE: hur man upprepar samma tabbe om och om igen Del2)

Ni kanske undrar hur man tänker, när man importerar hundar vars ärftliga hjärtsjukdom är dokumenterad sedan tio år tillbaka?
Det finns några möjliga svar på den frågan. Till exempel det uppenbara: man tänker inte alls, för hundarna är snygga. Eller: man hade ingen aning, för säljarna berättade inte och köparna visste inte tillräckligt för att fråga. Eller lika gärna: säljarna visste inte mera än köparna, därför sa de inget. Man kan spekulera i vilket svar som är det rätta, men i en avelstradition byggd på kunskap och öppenhet hade berättelsen som följer aldrig inträffat.
Importen av en hjärtsjukdom med dominant arvsgång fick ett efterspel i England och det efterspelet visar trots allt en viktig sak. En rasklubb kan ha självbevarelsedrift nog att sätta rasens fortsättning framför enskilda uppfödarintressen.



Paper

A pedigree-based genetic appraisal of Boxer ARVC and the role of the Striatin mutation

B. M. Cattanach, BSc, PhD, DSc, FRS,1 J. Dukes-McEwan, BVMS, MVM, DVC, PhD, DipECVIM-CA, MRCVS,2 P. R. Wotton, BVSc, PhD, DVC, MRCVS,3 H. M. Stephenson, BVMS, CertSAM, DipECVIM-CA, MRCVS,2,4 and R. M. Hamilton, MD, FRCPC, MHscCHE, CCDS5
Go to:

Abstract

The objective of this paper was to investigate by pedigree-based genetic means the origins and inheritance of arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) in UK Boxers and assess the role of the proposed causal mutation in the gene, Striatin (STRN). All ARVC cases traced back to a small number of imported American dogs deriving from the group of Boxers studied by Harpster (1983)



Bruce Cattanach står som huvudförfattare till den här studien från 2015. Den kartlägger släktskapen hos de drabbade hundarna i England – varenda en går tillbaka på de amerikanska importerna - och granskar tillförlitligheten hos testet som säljs som ett test för ARVC. Cattanach är inte bara genetiker. Han är sedan årtionden en av de ledande boxeruppfödarna i England; han har t ex har varit den brittiska rasklubbens genetiska rådgivare. De importerade amerikanska boxerhundarna, vars linjer han tittar på, gick förstås i avel i England, i den traditionella versionen av renrasavel. Inbreeding is standard procedure in show breeding, säger Cattanachs rapport som förklaring till de stamtavlor den ritar upp. Snart drog antalet rapporterade fall av den nya importerade hjärtsjukdomen iväg.

Vad gjorde den brittiska boxerklubben då? Den insåg, att det behövdes motåtgärder: plötslig oväntad död drar uppmärksamheten till sig. Cattanach åtog sig jobbet. Det gick inte lätt och inte enkelt, berättar källor från England – ryktet påstår att han en gång blev så less på vissa uppfödares motstånd att han avgick. Men han kallades tillbaka igen, för sjukdomen försvann ju inte för att han gjorde det och den blev faktiskt inte lindrigare för att man inte pratade om den.
Efter ett par års dispyter sjösatte boxerklubben alltså cirka 2004 sin handlingsplan efter Cattanachs riktlinjer. Det var flera år innan något gentest fanns att tillgå. Så uppfödare fick lära sig vad ARVC var, vilka släktlinjer det handlade om, hur den nedärvdes, de rekommenderades att publicerade de drabbade hundarnas namn på rasklubbens hemsida och att aldrig avla på en hund som lämnat sjukdomen och inte heller på den hundens avkommor. Vissa uppfödare gick längre än så och höll sig helt undan från de USA-stammade hundarna. Resultatet blev, att ARCV hölls inom en begränsad grupp, slutade spridas och snabbt minskade hos rasklubbens hundar – idag, knappt femton år senare, är inrapporterade nya fall därifrån sällsynta. Så då är slaget vunnet?
Mja. Eller nej. Inte som en svensk betraktare ser det.
Cattanach berättar två saker till. ARVC är i stort sett borta från KC-reggade show boxers, såvitt han kan bedöma, men han vet inte hur det står till med the pet and commercial population. Deras uppfödare når man ju ändå inte, så det man får hoppas på är att insikt och åtgärder liksom sipprar ner uppifrån.* Det där är en uppdelning, som inte finns i Sverige. Det handlar om de oreggade renrasiga boxervalparna, de som inte bedömdes vara utställningsmaterial utan såldes som sällskapshundar till vanliga köpare och så deras oreggade avkommor - plus hundar från valpfabrikerna. Hur många rör det sig om? Troligen vet ingen. Om anlaget finns hos dem – gissa hur det kom dit och om det riskerar att spridas vidare på ställen där ingen prestigefylld rasklubb har insyn och rapporterar fallen?
Uppfödare i England börjar återigen importera boxer från USA, såvitt jag förstår för att man nu som då drömmer om att plocka hem vinnare. På min direkta fråga om hur man tänker när man gör så, svarar Cattanach att för vissa är vinnandet all-important. Dessutom är omsättningen på uppfödare ofta snabb.* Förhoppningsfulla nya kommer till. Gamla försvinner och tidigare kunskaper försvinner med dem.
Det genetiska arvet efter tidigare uppfödares beslut försvinner däremot inte. Det gör inte de drabbade hundarna och valpköparna heller. De står kvar med skägget i brevlådan. Och för den som undrar: nej, det är inte Bruce Cattanachs kommentar till läget, utan min.


Bodil Carlsson 

* Bruce Cattanach, personligt meddelande

fredag 14 september 2018

SPEGELBILDEN del 1) : den högra sidan av saken

En grupp hundar importeras från Europa till Nordamerika och tar med sig DCM. Femtio år senare importeras en annan grupp hundar från Nordamerika till Europa och tar med sig ARVC. Samma mönster, samma sorts skeenden, olika konsekvenser.



Det finns två  varianter av DCM. En av dem förekommmer hos hundar av ett antal raser. Den andra, den där fibrer och fettceller ersätter döende hjärtmuskelceller, känner man till från två raser, doberman och boxer. Forskningsintresset beror på (och finansieras) delvis därför att den finns hos en annan art också – vår egen.
Hos doberman angrips vänster hjärthalva och hos boxer framförallt den högra: ARVC står för Arrythmogenic Right Ventricular Cardiomyopathy, arytmiskapande högerkammarhjärtmuskelsjukdom. Båda  nedärvs som ett dominant anlag. Båda finns med från födseln, men börjar oftast visa sig upp i medelåldern och blir vanligare ju äldre hunden blir, även om unga hundar också kan råka illa ut. Doberman riskerar både dödlig hjärtarytmi och vänsterkammarsvikt. För boxern är risken för hjärtrytmrubbning - som kan komma som plötsliga svimningsattacker eller som plötslig död - större än risken för kammarsvikt, men boxer med den högersidiga sjukdomen överlever trots det både längre och bättre än dobbarna med den vänstersidiga och nedärvningen tycks inte slå igenom lika kraftfullt hos boxer. Ett tips: får ni  välja vilken hjärthalva ni vill ha angripen av en sjukdom, ta den högra! Om en hjärtkammare stannar i språnget, så gör ni det också. Kortvarigt, om hjärtat startar om igen; för gott, om det inte gör det. Men ren högersidig hjärtsvikt, med vätska i buken, är trots allt lättare att uthärda och lättare att behandla än vätska i lungorna. I det här lotteriet om förluster drog boxern vinnarlotten.

Biologinördar kan grubbla länge över hur en sjukdomsprocess kan gå loss på muskelcellerna i bara den ena halvan av hjärtat och jag erkänner – jag har letat efter en tänkbar förklaring, men hittar ingenting bland alla rapporter om den mänskliga motsvarigheten till ARCV och dess alla tänkbara orsakande gener. Däremot behöver man inte grubbla över hur alltsammans startade för just boxer. En stackars boxer i USA åkte på en mutation – eller mera sannolikt först en och sedan åtminstone en till, som det ser ut nu. Den ena mutationen, den som först identifierades och länge misstänktes vara den enda boven i dramat, ger en felaktig version av en proteinmolekyl. Det låter väl inte så farligt?
Men det kan det vara. När det där lilla proteinet ingår i en apparat, som fäster celler vid varandra. Länkar ihop dem, håller dem på plats. Tänk er en tryckknapp! Hjärtats muskelceller, som i varje hjärtslag tänjs ut, dras ihop, tänjs ut, dras ihop, tänjs ut - de, om några, behöver stadiga tryckknappar som håller dem sammankopplade och på rätt ställe. Med tiden upptäcktes sjukdomen ARVC hos den där amerikanska boxerns amerikanska avkommor. Den beskrevs veterinärmedicinskt redan 1983. Tjugofem år senare hade ny teknik gjort det möjligt att hitta en gen, som många drabbade boxer hade i muterad form. Det var STRN, genen för striatin, tryckknappsproteinet. Och ett efterlängtat test klev därmed in på scenen till boxeruppfödarnas lättade jubel.

Men vad hände dessemellan? Mellan 1980-talet och 2010?

Det som hände var att sjukdomen spreds. Den blev allt vanligare i USA – en amerikansk veterinär uppger att ARVC hos boxer nu kan ligga på runt 25%. Fundera lite på vilken sorts tradition inom aveln som gör att ett skadligt anlag – ja, även ett som inte visar sig förrän i medelåldern - kan spridas till upp emot en fjärdedel av alla hundar!
Tigandets tradition, säger jag. Plus, förstås,  den gamla vanliga släktskapsaveln. Från USA kom ARVC hursomhelst till England. På nittiotalet importerade engelska boxerentusiaster amerikanska hundar med härstamning direkt från den grupp som hade studerats och beskrivits 1983.

Bodil Carlsson

fredag 7 september 2018

DEN VÄNSTRA SIDAN AV SAKEN: om rasklubbar och gentester

Hur kom DCM till USA?
Saxat från Svenska Dobermanklubbens hemsida. Man berättar om en studie gjord 2007 av en amerikansk genetiker, Meurs :

I studien undersökte de nära besläktade hundar som i rakt nedstigande led var släkt med en av sju mycket kända dobermannhanar som
importerades till USA år 1941. Dessa sju hanar producerade många champions och därmed avelsdjur och redan år 1950 uppskattades hälften av USA’s champions vara släkt med någon av dessa sju hanar.Tre av de sju importerade hanarna rapporterades ha dött i hjärtsjukdom.

Efter att ha kartlagt detta klassiska recept på hur man enklast slår sönder en ras, fortsatte Meurs studera doberman. 2011 rapporterade hon om en gen, PDK4, som i muterad form ger en störning i cellens energiomsättning, vilket kan förklara hjärtmuskelcellernas död. Det hette i ett antal år, att det var en dominant gen med ”ofullständig penetrans” - trots att den gav sjukdom hos alla som hade den, var sjukdomen inte lika tidig eller lika allvarlig hos alla. Det finns förstås sedan flera år ett test för den genen, numera ofta kallad DCM1. 2016 rapporterar Meurs att hon funnit ännu en gen. Den påverkar hjärtats förmåga att dra sig samman. Det sägs nu, att vardera genen ensam kan ge DCM, men att risken är större om båda generna finns hos samma hund. NCSU, universitetet i North Carolina, där Katherine Meurs är anställd, erbjuder alltså nu test för båda. Generna heter i deras annonser numera NCSU DCM1 och NCSU DCM2. Lyssnar man på en inspelad föreläsning, får man lära sig det här:
Idag anser Meurs och hennes team, att av doberman med enbart DCM1 blir 37% sjuka. Resten blir inte sjuka. Av dobbar med bara DCM2 blir 50% sjuka. Resten blir inte det. Av dobbar med båda generna, blir 60% sjuka... Så kan det finnas ytterligare en gen med? En DCM3-gen? Eller flera? Det vet man inte. Rådet blir att oavsett hur testerna faller ut, så skall uppfödare fortsätta följa sina avelsdjur med årliga ultraljud och 24-timmars-EKG. Att det finns mer än en enda faktor med i spelet, när det pratas ”ofullständig penetrans”, d v s att ibland slår genen igenom och ibland inte – det är väl klart. Men vilka är de andra faktorerna? Och hur många? Hos människa finns 24 olika gener inblandade i den sjukdomsbild som heter DCM även hos oss. Och, frågar sig en amatör – om det kan finnas ett antal ytterligare, idag okända gener med i spelet, varför skall vi gentesta för de två som vi känner till? Bara för att vi känner till dem?
Dobermanägarnas problem är inte en, eller två eller flera, gener. Deras problem är att deras ras har en genomsnittlig DNA-skattad inavelskoefficient på 43% och ännu mindre variation i sina immunförsvarsgener. DCM är hösten som kommer för en ras, därför att renrasavelns uppfödartradition haft ett långt sommarlov från biologins verklighet. 

 
Om min storvinnande hund börjar gå i avel när han är två och fortfarande symptomfri, om han är eftersökt av alla lättimponerade tikägare, om hans söner gör samma race med samma tidiga avelsdebut och lämnar många kullar – vad har jag och tikägarna lämnat efter oss, när hanen sju år gammal dör i DCM med en femtedel av rasens valpar efter sig och ytterligare tio - tjugo procent är hans barnbarn? Några generationer till och hans dominanta anlagskombination finns hos många. Några generationer till och ni kan inte komma undan min hane och hans gener, för de finns hos minst hälften av kontinentens hundar och dessutom, efter lite vinnarexporter, lika ofta på grannkontinenten. Då är det lite sent att börja gentesta. Testerna kommer att bekräfta det vi redan vet: att vi har ett jätteproblem. Men de talar inte om hur vi skall åtgärda det.

Enligt Carol Beuchat visar statistiken en stadig ökning av DCM hos amerikanska doberman från 90-talet och framåt. Om ökningen fortsätter i samma takt uppskattar hon att alla amerikanska doberman har DCM omkring 2040. Niels Pedersen säger försiktigt, att han tror att anlag kan vara i stort sett fixerade redan nu: det finns ”ett desperat behov” av hundar med genetisk variation. Han föreslår att dobermanuppfödarna letar genetiska öar i delar av världen, dit inflödet av tyska och amerikanska hundar inte har nått. Till exempel kan det kanske finnas några genetiska fornlämningar från det slutna Östblockets dagar. ”Desperat” är väl ett bra ord för den förhoppningen. Vad säger dobermanklubbarna?
Den brittiska och KC säger ingenting, såvitt jag kan se. För avelsdjuren rekommenderas HD-röntgen plus en gentest för koagulationsrubbningen von Willebrands sjukdom, som doberman råkar ha i den lindrigaste formen, den som brukar vara gott och väl överlevbar. AKC :s ”rasinformation” ligger på TV-reklamens nivå. Man får leta och klicka, innan man hittar något om DCM. Doberman ligger på femtonde plats i listan över mest populära raser i USA och rasklubben kanske satsar på att hålla den där.
Vad gjorde den tyska dobermanklubben? Den startade en undersökning av förekomsten av DCM enligt studien från 2010. Men undersökningen avbröts, eftersom man hittade så få hundar med sjukdomen. Hur är det möjligt? Enkelt - man screenade hundar, som ännu inte hade börjat gå i avel. Alltså den åldersgrupp där symptomen är minst vanliga. Man tittade på hundar under tre år! Jag vet inte, vem som satt i styrelsen när det beslutet togs, men med tanke på vad som redan då var känt om DCM och ålder är det lätt att gissa vilka som var frånvarande. Hjärtspecialisterna, genetikerna och valpköparna.

Vad gör den svenska dobermanklubben?
Den lägger korten på bordet. Klubbens hemsida ger en bra DCM-översikt för valpköpare och uppfödare och man lägger till SLU-studier om undersökningsmetoder. Den metod som rekommenderas för avelsdjur är årliga undersökningar på samma sätt som i studien ovan, med 24-timmarsEKG och ultraljud, och att avelsdebuten bör läggas så sent som möjligt. Det blir omständligt och dyrt – undersökningarna är långtifrån gratis – och givetvis besvärligt med tikarna, vars avelsdebut ju inte kan skjutas upp hur länge som helst, men så vill man ha det. För hundar som undersökts av godkända hjärtspecialister publicerar klubben namn, reggnummer och undersökningsdatum med resultat. Man publicerar obduktionsresultat: dödsorsak DCM eller inte? Man vill att veterinärklinikerna skall informeras om DCM hos doberman, så att de inte missar några fall. Och så startar man tillsammans med SKK en fond för hundägare, som vill screena sina levande hundar, eller obducera de döda, men som inte riktigt har råd.
För den rasklubben tar jag av mig hatten. Jag hoppas att de vill ta emot den lilla slant, som jag har skickat till fonden. Av uppriktig tacksamhet över att den svenska traditionen är annolunda än den engelska och amerikanska. Av tacksamhet för att den håller sig till sanningen och bryr sig om sina hundar och deras ägare. Om det är möjligt att rädda en hotad ras, så är det här man börjar.
För vad är alternativet?
En ny Karl Dobermann med en ny tids kunskap. Organiserad, långsiktig utkorsningsavel.

Bodil Carlsson



torsdag 6 september 2018

DEN VÄNSTRA SIDAN AV SAKEN: en rashistoria och dess konsekvenser



Det har gått trettio år sedan jag först mötte en doberman och jag minns honom fortfarande. Attackhunden från otäcka filmer, ni vet, den livsfarliga hunden? Han kom travande i en skogsglänta i utkanten av Göteborg, rakt mot min sheltievalp och mig, och han rörde sig så vackert att jag glömde bort att vara rädd. Strax var han framme, hälsade överseende på den entusiastiska valpen och vände sig mot matte, som kom traskande efter med kopplet i ena näven och en boll i den andra.
Attackhunden från filmerna var en helt normal hund i verkligheten. Kraften och snabbheten styrdes av ett helt normalt hundhuvud: han visste när man inte slåss. Matte kastade bollen. Vi fick se honom i fullt språng och någonstans där gick det upp för mig att vackert är något man ser i flykten. Vackert står inte stilla.
Det gör inte tiden heller. Idag hittar jag en stor internationell facebookgrupp, där dobermanägare undrar om det kan finnas något foder, som ökar deras DCM-diagnosticerade hundars överlevnad något litet. Eller åtminstone förbättrar deras livskvalitet under den tid de har kvar.

Vårt hjärta börjar slå långt innan vi föds och slutar någon minut efter att vi är döda. Däremellan slår det mellan en gång och många gånger varje enskild sekund av våra liv, två hårt samarbetande, synkroniserade nävar. Höger halva hämtar hem blod från kroppen och sprutar till lungorna, vänster halva kramar mot högt tryck ut blod till hela kroppen och alltsammans hålls igång av ett självstyrande nät av elektriska fibrer. Ja, det där vet ni ju. Så tänk er in i hur det är att försöka leva, när de outröttlig pumpande nävarna har blivit till tunna, sladdriga ballonger. När hjärtmuskelcellerna är borta och fettceller och fibrer tar sig in i deras ställe.
Där har ni DCM, dilaterad cardiomyopati. Den finns hos oss också, bara inte så ofta. Ord för ord: uttänjd, hjärta, muskel, sjukdom. Den uttänjda hjärtmuskelns sjukdom. Den snabba dödens sjukdom, om man har tur och de elektriska fibrerna slås ut så att hjärtat stannar mitt i språnget. Annars följer en inte lika snabb och inte lika skonsam exit från livet.
Forskningsrapporterna säger att vid den tiden då jag mötte dobermanhanen i skogen var DCM hos rasen redan känd. Först uppmärksammades den på 1980-talet i USA, där man snart lärde sig att DCM var ovanlig hos unga hundar, men allt vanligare i takt med att hundarna blev äldre. Hur var det i Europa? Den här 8 år gamla rapporten gjorde sammanlagt 775 undersökningar med ultraljud av hjärtat och 24-timmars-EKG på 412 europeiska doberman från olika länder för att se, om det var någon skillnad på vår sida av Atlanten. Målet var att bedöma vanligheten med stigande ålder. Hur föll det ut?
Det såg lika illa ut här som där.


Prevalence of Dilated Cardiomyopathy in Doberman Pinschers in
Various Age Groups
G. Wess, A. Schulze, V. Butz, J. Simak, M. Killich, L.J.M. Keller, J. Maeurer, and, K. Hartmann
Background:
Dilated cardiomyopathy (DCM) in Doberman Pinschers is an autosomal dominant inherited disease. The
prevalence of DCM in Doberman Pinschers of various age groups in Europe is currently unknown, but this information would be important to develop recommendations for screening programs. /../

Results:
DCM prevalence in various age groups was as follows:
age group 1 (1 to2 years) 3.3%,
age group 2 (2 to 4years) 9.9%,
age group 3 (4 to 6 years) 12.5%,
age group 4 (6 to8 years) 43.6%,
and age group 5 (over 8 years) 44.1%.

Ni läser rätt. DCM nedärvs som en autosomalt dominant anlag – det bryr sig inte om könet utan tar tikar lika gärna som hanar, även om tikar brukar visa symptomen senare – och hunden som har anlaget måste få sjukdomen, förr eller senare, precis som den måste lämna det till 50% av sina valpar.
Förekomsten inte bara ökar med åldern, den tar ett plötsligt kliv uppåt från ungefär tre års ålder och ytterligare ett brant hopp uppåt från sexårsåldern. Därefter fortsätter den stiga, så att för varje år som går i en anlagsbärande dobermans liv ökar risken för att DCM skall börja visa sig. Hur många dobermanägare väntar på dagen med de första tecknen? Svimningsattacker? Andfåddhet? Hosta? Tilltagande trötthet? 
 DCM är alltid dödlig. För hälften av alla doberman är frågan alltså inte om de skall dö i DCM, utan när. Och så förstås hur. Mitt i språnget eller en tungandad vecka i taget? De flesta överlever förvånansvärt kort tid efter diagnosen – veckor, i bästa fall månader. Inte år. Någonstans ser jag en siffra på 25% snabba dödsfall. Hunden som springer efter bollen och faller ner och är borta eller bara ligger död på hallgolvet, när ägaren kommer hem från jobbet. Resten dör i vänsterkammarsvikt. Den snabba döden är retledningssystemets frånfälle; den långsamma är kammarväggens.

Bakgrunden till DCM (och andra ärftliga sjukdomar) hos doberman kan ni läsa här: www.vgl.ucdavis.edu/services/dog/GeneticDiversityInDoberman.php . En kort berättelse om rasens historia sammanställd av Niels Pedersen, som undersöker dobermangenetik vid UC Davis. Han erbjuder förstås ett genetiskt test – inte för någon enskild sjukdom, för en gångs skull, utan för graden av genetisk variation inom rasen och nej, det är ingen slump att en rashistorik numera hittas på hemsidan för ett genetiskt labb! Men han bjuder också på länkar till en bildkavalkad värd att se.
Det är den klassiska berättelsen en gång till. Karl Dobermanns ursprungshundar var få, men blandade – tuffa hundar, smarta hundar, snabba hundar. Han tog det han kunde hitta som passade och mixade en blandning som skulle ge det han ville ha, lojala vakthundar som kunde bita ifrån.
Sedan tog andra över. Det blev en period av intensiv standardisering, stängd stambok, matadorer och hundar som redan på fotona från tidigt 1900-tal ser förvånansvärt lika ut. En flaskhals efter första världskriget med en hane som ”räddade rasen” genom att överleva och bli förfader till de flesta dobermanhundar därefter och som beskrivs som ”huvudsakligen ansvarig för att starta om rasen i Tyskland”. En annan som ”överanvändes” och en tredje som blev betydelsefull och framgångsrik för att han faktiskt hade alla de tidigare matadorerna i sin egen stamtavla. Att se och läsa om dem ger en egendomlig känsla. I ljuset av vad som händer nu är presentationerna av foton från detta ärorika förflutna som ett gravtal över en ras. Någonstans i dessa vackra, kraftfulla hundar med högburna huvud fanns redan de muterade generna bakom DCM.
Idag finns de överallt.

Bodil Carlsson

tisdag 4 september 2018

NÅGOT HÄNDE MED BULLTERRIERN


1915

                                       Början.... (Dog Breed Historical Pictures)

När jag började skriva den här serien om genetisk variation och inavelsproblem för några  månader sedan var det mest för att lära mig själv mera om saker som hade tagits upp på ett märkligt sätt på Collieklubbens årsmöte. Jag insåg att jag inte förstod dem. Jag behövde veta mera. Det blev som det brukar när man ger sig ut på resa: man hamnar på platser, som man inte visste fanns.
Flera gånger under färden har jag hittat saker som fick mig att dra efter andan och en gång har jag gråtit. Engelska KC.s omdefinition av inavelsgrad i samband med datoriseringen fick mig att tappa hakan (se Uppgång och fall 2018 07 12). Tanken att den verkliga inavelsnivån i våra hundraser inte har mycket att göra med den vanliga femgenerationersberäkning som vi brukar kunna få hjälp med av offentligt tillgängliga uppgifter från SKK har varit svår att komma över.
Tack förresten, SKK, medan jag är i farten! I en del avseenden är ni ett stort föredöme. Inte alla nationella kennelklubbar tillhandahåller sådant som Hunddata, Avelsdata och RAS. Men här räcker inte era insatser till.
Den verkliga inavelsgraden är mycket, mycket högre än vi vill veta.

Det var bland det första jag lärde mig. Per-Erik Sundgren hade rätt. Våra hundar, individer och hela raser, hotas av inavelsnivåer som ny DNA-teknik beräknar på ett sätt som de gamla stamtavleanalyserna inte kan och som stamtavlorna över tre eller fem generationer inte säger ett skvatt om. Det andra jag lärde mig var att de kommersiella gentestlabben ökar explosivt i antal. Gentester erbjuds som quickfix i ras efter ras för att lösa ett problem som i botten är gemensamt för alla raser. I bästa fall är gentest en stor hjälp. I värsta fall är de en snabb och effektiv lösning på ett problem som en ras inte har, men ingen lösning alls för det problem den har, vilket låter paradoxalt – men så tror jag att det är för LAD-testet och bullterriern. Ofta kommer gentesterna ur forskning som har startat i hopp om att hitta den genetiska orsaken till en människosjukdom. En sorts LAD finns hos oss också, men för vår del botas den lätt med att tillföra rejäla doser med zink. Så lätt är det inte för bullterrierägare. Deras hundar dör.

Men det var inte det som fick mig att börja gråta framför skärmen. Det var inte fotot på en död bullterriers illa åtgångna tassar heller. Om den recessiva genen för LAD finns hos 22% av alla bullterriers, så verkar det ju förfärligt. Inte sant? Man måste självklart börja gentesta!
Måste man det?
Låt oss tänka efter.
Om 22% av hundarna i en ras har en recessiv gen i enkel upplaga och om uppfödarna varken föredrar eller väljer bort de symptomfria bärarna, som de ju inte kan identifiera, så betyder det att i genomsnitt 22% av 22% av alla parningar sker mellan två bärare av genen. Det betyder att 0, 22 x 0, 22 = 0, 044 av alla kullar har två bärare som föräldrar: det är drygt 4%.
Av de kullarnas valpar har en fjärdedel genen i dubbel upplaga – aningen mer än 1 procent. En enda procent föds alltså med LAD. Sjukdomen är oftast igenkännbar för någorlunda erfarna uppfödare strax efter födseln. En valp som är mycket mindre än de andra, en valp som diar dåligt, en valp som inte växer som den skall, en valp med onormalt välvt gomtak där mat samlas och luktar illa: så ser homozygoti för LAD-genen ut. Förslagsvis tar man skonsamt bort den valpen. Den kommer ändå att dö före två års ålder.
Vad händer då? Uppfödaren förlorar en valpinkomst. Rasen fortsätter med 22% symptomfria bärare. Inte mindre, men inte mer.

Det finns bättre skäl att använda ett gentest än en utebliven inkomst på 1%. Det finns bättre skäl att grubbla över inavelsgraden än en recessiv genfrekvens på 22%, som i dubbelupplaga slår ut en hund av hundra långt innan den kan gå i avel. Det här, däremot, som står i svenska rasklubbens RAS, var en av de saker som har fått mig att läsa flera gånger för att vara säker på att jag ser rätt:

"Vad beträffar livslängden har den ökat från mätperioden 1995-2002 från 4.8 år till 5.8 år 2002-2011. Generellt är vanligaste dödsorsaken hud, njurar och hjärta. Snittåldern för död i olika sjukdomar har höjts utom hjärta. Bullterrier ligger i högsta försäkringsklassen hos Agria, Sveland och Folksam."
 

Den enda bullterrier jag har träffat gick sitt MH en höstdag, då solen sken över alla uppkrattade gula löv längs banan. Sprallig av glädje forsade den fram genom lövhögarna, så upptagen av att leka att den varken hörde skotten eller husses inkallningsförsök. Det var ett av de roligaste MH jag har sett: man blev glad av att stå och titta på någon som njöt så av att vara vid liv.
Knappt sex år?
Jag tror att bullterrierfolket älskar sina hundar som jag älskar mina. Jag tror att de värdesätter rasens egenskaper på samma sätt som vi värdesätter colliens. Jag ser att rasklubben på ett hedervärt sätt anger aktuella inavelsgrader, att man redovisar hälsoenkäter, att man nämner 90-talets överanvändning av ett fåtal namngivna hanhundar och att man uppmuntrar uppfödarnas vilja att använda fler hanar i aveln.
Men jag tror att det finns något, som de kanske inte vet, därför att informationen är ny. I de DNA-baserade uppskattningarna av verklig inavelsgrad hos drygt 150 raser ligger bullterriern på andra plats.
Ökar den genomsnittliga livslängden, om man successivt - en tålmodigt planerad generation i taget - väljer bort just genen för LAD? Hudallergierna, njursjukdomarna och hjärtklaffsfelen som sätter livslängden ligger kvar, inbakade någonstans i alla de andra generna.


Bullterriern stamboksfördes i sitt hemland omkring 1870 – det gör rasen till en av de äldsta med stambok. Den kom ur korsningar mellan bulldogg och terrier, tänkt som kamphund innan det folknöjet förbjöds och rasen i stället adopterades av en man som ville skapa en ”gentleman´s companion”, helst i elegant helvitt.
Den vita färgen medförde så mycket dövhet att andra uppfödare började blanda in färg. Det gick för sig på den tiden; det skulle starta krig idag. Men fortfarande 1915 hade bullterriern en huvudform som inte var uppseendeväckande. Den är lite annorlunda nu. Vad ligger bakom inavelsgraden hos bullterriern? Den slutna stambokens längd i år och generationer, eller en lång period av intensiv inavel för att fixera en viss huvudform?
Eller kombinationen av båda?



                                                      … och slutet?

Någonting hände med bullterriern, men det var inte annorlunda än det som hände med många andra raser. Vi har ett problem med samma rötter. Det vi lär oss om situationen för en annan ras hjälper oss att förstå situationen för vår egen. Och nej, det var inte LAD och bullterrier som fick mig att gråta. Det var en facebookgrupp för dobermanägare, som bad varandra om hjälp med att välja foder.

Bodil Carlsson

söndag 2 september 2018

L STÅR FÖR DÖDLIG



De senaste femtio åren har alla stamböcker i praktiken varit stängda, vilket har fått en del tydliga konsekvenser. Per Erik Sundgren, som var en av våra mest välrenommerade genetiker, hävdade återkommande att den släktskapsavel som förekommer inom alla raser successivt leder till en försämrad sundhet. Han skrev redan på 80-talet att ”till skillnad från vad de flesta tror är våra hundraser inte särskilt gamla som rena raser. Den mycket strikta rasaveln har i många fall inte mer än ca 50 år på nacken och bara i ett fåtal fall mer än 100 år. Flertalet hundraser är just i början av den tidsperiod då inavelsskador kan förväntas börja visa sig på allvar. Om inga planerade motåtgärder genomförs kommer med största sannolikhet problemen inom rasaveln att förvärras kraftigt de närmaste 10–20 åren.

Citatet är hämtat ur en artikel publicerad i en specialklubbstidning 2018. (Artikeln kommer att återges i sin helhet senare.) Trettio år har gått sedan Per-Erik Sundgren gjorde sin förutsägelse. Slår den in?
I dagarna är det tio år sedan Pedigree Dogs Exposed visades. Fundera på om det var en slump att filmen om genetiska sjukdomar hos renrashundar slog ner som en explosion i hundvärlden just då - eller om det var en slump att svallvågorna efter den fortfarande finns kvar.

Det är mindre än månad sedan svenska SLU publicerade det här:

Överdriven exteriör och genetiska sjukdomar oroar

Senast ändrad: 22 augusti 2018

ErlingStrandberg 618.jpg


Enskilda länders kennelklubbar har stort inflytande över hundaveln. En enkät till 15 nationella kennelklubbar visade att de rangordnar överdriven exteriör och genetiska sjukdomar som viktigast att prioritera i sitt arbete den närmaste tiden.
Även om huvudsyftet för nationella kennelklubbar är ganska lika mellan många länder kan förutsättningarna variera. Lagar och regelverk, andelen hundar som är anslutna och synen på hundars välfärd skiljer sig åt, och detta kan påverka vad man tycker är mest prioriterat att arbeta med. För att undersöka vad man ser som de högst prioriterade problemen inom hundaveln och hur man arbetar med dessa skickade forskare från Sveriges lantbruksuniversitet tillsammans med internationella kollegor ut en enkät till nationella kennelklubbar. Forskargruppen fick svar från 15 länder, varav 11 i Europa.
Alla svarande kennelklubbar rangordnade överdriven exteriör och genetiska sjukdomar som högst prioriterat. Dessutom ansåg 14 av 15 att problem med inavel och förlorad genetisk variation var högprioriterat. Mer än hälften av länderna redovisade information om sjukdomar i stamtavlan och man gav rekommendationer om, eller hade krav på, sjukdomsfrihet före användning i avel för mer än hälften av sina raser. Bara fyra länder saknade helt information om inavelskoefficienter eller parningsguide via nätet. (min fettning)
Forskningsnyhet från SLU, publicerad i augusti 2018

 SLU illustrerar sin nyhet med ett porträtt av en mops, vilket väl kommer att leda till det sedvanliga ramaskriet från den officiella rasklubben; det är sällan något annat hörs från det hållet, när deras exteriörideal ifrågasätts. Det finns ingen illustration av genetisk sjukdom. Jag hade kunnat bjuda på en: ett foto av en bullterriervalp med den recessiva sjukdomen LAD, letal acrodermatit, taget strax före obduktionen. Jag tror bara inte, att ni hade tyckt om att se det. L står för dödlig, men vägen till slutet är inte rolig.
Rasklubbarna för bullterrier har överlag inte mycket att säga om LAD. Sjukdomen har varit känd sedan 1980-talet och talesmannen för den forskargrupp, som i början av året identifierade den ansvariga genen, kallar i en intervju genen för LAD ”alarmerande vanlig”. På direkt förfrågan om hur vanlig ”alarmerande vanlig” är, svarar han via mail så här på söndag morron att  i en på måfå utvald grupp om 166 finska bullterriers och miniatyrbullterriers utan sjukdomstecken visade sig 22% vara bärare av genen för LAD   och att genlabb i andra länder hittat lika hög eller högre frekvens. *
En sak som jag har funderat allt mera över sedan jag började den här lilla resan genom renrasavelns genetik är förhållandet mellan de nationella kennelklubbarna och rasklubbarna. Att delar av kennelklubbarnas ledning, åtmoinstone i Europa, numera inser att exteriöra deformiteter måste prioriteras på annat sätt än genom utställningsvinster och att genetiska sjukdomar i en sluten stambokspopulation med nödvändighet ökar i frekvens och kan komma att slå ut hela raser – det betvivlar jag inte. Men hur mycket förstår rasklubbarnas ledande uppfödare?
Frågar de sig någonsin hur en dödlig gen blev så spridd? Frågar de sig vilka gener som blir mera vanliga, om man använder ett DNA-test för att göra en gen mindre vanlig? Undrar de, om det värsta som kan hända en valp är att den har en sjukdom som kan upptäckas och avslutas på ett skonsamt sätt strax efter födseln, så att hunden slipper plågan och valpköparen sorgen?
Eller om det är värre i det långa loppet med gener som inte medför död – bara ett sämre och kortare liv?


Bodil Carlsson





Personligt meddelande från professor Tosso Leeb, institutionen för genetik, Berns universitet. Artikeln hittar ni här:



https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1007264